Nella giornata inaugurale il Pontedera ospiterà il Siena davanti al proprio pubblico. La prima trasferta sarà invece a Como nel turno successivo. Fra le novità stagionali le partite programmate il 26 e 30 dicembre; seguirà una sosta fino al 22 gennaio. Di seguito tutte le partite dei granata.
1) Pontedera-Siena 28 agosto 2016 (ritorno 26 dicembre 2016)
2) Como-Pontedera 4 settembre 2016 (ritorno 30 dicembre 2016)
3) Pontedera-Olbia 11 settembre 2016 (ritorno 22 gennaio 2017)
4) Pistoiese-Pontedera 14 settembre 2016 (ritorno 29 gennaio 2017)
5) Pontedera-Racing Roma 18 settembre 2016 (ritorno 5 febbraio 2017)
6) Pro Piacenza-Pontedera 25 settembre 2016 (ritorno 12 febbraio 2017)
7) Pontedera-Lucchese 2 ottobre 2016 (ritorno 19 febbraio 2017)
8) Viterbese-Pontedera 9 ottobre 2016 (ritorno 26 febbraio 2017)
9) Pontedera-Lupa Roma 16 ottobre 2016 (ritorno 5 marzo 2017)
10) Renate-Pontedera 23 ottobre 2016 (ritorno 12 marzo 2017)
11) Pontedera-Tuttocuoio 30 ottobre 2016 (ritorno 19 marzo 2017)
12) Pontedera-Cremonese 6 novembre 2016 (ritorno 26 marzo 2017)
13) Prato-Pontedera 13 novembre 2016 (ritorno 2 aprile 2017)
14) Pontedera-Arezzo 20 novembre 2016 (ritorno 5 aprile 2017)
15) Livorno-Pontedera 27 novembre 2016 (ritorno 9 aprile 2017)
16) Giana-Pontedera 4 dicembre 2016 (ritorno 15 aprile 2017)
17) Pontedera-Carrarese 7 dicembre 2016 (ritorno 23 aprile 2017)
18) Piacenza-Pontedera 11 dicembre 2016 (ritorno 30 aprile 2017)
19) Pontedera-Alessandria 18 dicembre 2016 (ritorno 7 maggio 2017)